前新竹市市长林智坚、行政机构副负责人郑文灿的台大硕士论文被认定抄袭而撤销学位，担任两人指导教授的前“国安局长”陈明通被校方认定有所缺失，但没有被解聘，引发各界关注。台大校长陈文章28日晚间首度对外说明，并强调是以教师身分表态，认为陈明通毁损台大声誉，应公开道歉，至于审定报告的部分，则没有争议，是否公开已不重要。
陈文章表示，他从台大教师的身分看待此事，认为陈明通确实指导不周，必须负责，即便每位教授都有不同的指导方法、逻辑，但陈明通日前公开表明指导的论文都有撰写公版，由此可见，学生论文有相似之处，恐怕是导致论文具有暇疵的原因。
陈文章也谈到论文写作与指导的逻辑，强调论文是否周延，不只要看研究方法，问题意识、研究结论也都必须加入检视，即使是文献分析，也必须有创新性，一定要提出创见才行。
至于陈明通出面为林智坚喊冤，强调将持续为其平反，陈文章认为，既然两位指导学生面对学位被撤销都没有再采取后续申诉，陈明通担任其指导教授，应该主动出面向大众与社会公开道歉。
另外，对于陈明通最终未被台大解聘，引发外界关注，陈文章说，他了解这起事件对台大校誉伤害非常严重，最后只能这样处理，感到非常遗憾，为此呼吁台教育部门修“法”，将论文指导责任纳入其中。（台湾“中时新闻网”）
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